108學年度高雄醫學大學附院中和紀念進行組織變動，經高雄醫學大學董事會通過，將會計室變更為財務室，並由歲計、帳務、經費統計及成本會計四組，縮減為歲計經費、帳務及成本會計三組－目前設有主任一人、組長三人及組員12人。

民國46年高醫附設醫院成立，會計室伴應運醫院組織功能而生，肩負會計、財務與稽核的使命，在歷任張泉和，陳登枝主任卓越領導下，奠立會計室業務穩健之基石。

嗣後傅有舜先生接任後，鑑於制度重要性，遂於民國67年建立「私立高雄醫學院附設中和紀念醫院會計制度」，並於同年獲財政部核定本醫院為會計紀錄完備正確之醫院(67.12.8台財稅第38168號函)，對會計室發展有深遠之影響，且對本醫院會計帳務公信力有正面提升之作用。另為使醫院各科瞭解經營成果及重視成本觀念，遂於民國68年編定成本會計制度，提供各科收支資料，作為層峰決策及各科經營改善參考。

會計室自民國75年起率先推動薪資資訊化工程，嗣後對會計業務電腦化之開發，投入難以計數的心血與時間，與資訊室互動下歷經數年的研究開發，至今本室已完成薪資、帳務、財產、費用及成本等五大系統。

民國79年黃宗人副院長積極推動下，高醫附設醫院首度引進績效觀念，建立以科績效為主的「主治醫師臨床績效制度」(後改為科績效制度)，將成本會計與績效制度結合為全國首創之制度，為增加成本會計公信力，乃設立會計制度暨績效小組歷經多年討論，修訂成本會計制度。

民國86年時任副院長洪純隆教授為鼓勵醫師積極投入醫療服務，遂引進「個人績效制度」，本室配合相關作業及績效發放，至此後會計室的任務與功能是帳務、稅務、成本並重，三足鼎立的局面。

鑑於內外環境變化，院內分工及成本觀念的加強，民國92學年度委請勤業會計師事務所檢視及編修符合現階段的成本會計制度,並首度以次專門科為責任中心的成本制度，此制度變革將本院成本會計帶入新的里程。

另為加強成本作業及分析，乃於94學年度通過增設成本會計組專責成本會計及分析工作，加強成本觀念灌輸，提供更為正確的成本報表與順暢的成本查詢作業，提升成本作業水準。

為使會計作業標準化乃於民國93年間以一年時間參酌一般會計原則及會計相關規定及其他部門與會計作業流程有關的規章與作業編定「一般會計制度暨內部管理及稽核制度」，以加強醫院內控成效、內部稽核及作業標準化，至此會計室作業更臻正確與完整。

會計室發展為漸進式，民國50年代僅四位成員，75年會計室設立統計、歲計及帳務三組，會計成員擴增為15人，民國95年增設成本會計組，再擴增為17人，會計室發展至今已成為兼具會計成本與財務管理功能之部門，為本院重要部門之一。