創始歷程
醫院成立初期，總務由學校總務主任兼任，直至53年附設醫院才有專任之總務主任。總務室初期除目前工作外，亦需負責環保、工安、工務、洗衣部等工作，隨著醫院擴建及業務需要，逐步成立各相關部門，由專業人員來處理相關業務，並於103年8月1日再將採購、財保與洗縫業務另外成立資材室專責。總務室則專職於事務組、保安組、出納組業務。108年8月1日生效之組織規程修正公布，將環保業務隸屬總務室，新增環保組，即總務室下設事務組、出納組、保安組及環保組等四組。歷任主任為莊水炎、林良三、葉澤民、周建河、邱亨嘉、陳建立、洪志毅、潘靜雲、李昆旺、李彩雲、周建河、李彩雲、林增玉、李彩雲 。
業務職掌
一、有關現金、票據、保證金等之出納與保管。
二、有關全院事務性、宿舍、車輛等管理及會場租借佈置。
三、有關外包業務管理與統籌。
四、有關院區安全維護管理事項。
五、事業廢棄物及廢水處理。
六、環境衛生消毒及院區景觀維護。
業務歷史事件
一、外包業務管理
104.8.1外包資訊管理系統正式上線使用，同年10.27自營養部及職安室移轉承接美食商店街業務管理及外包稽核管理小組幹事職務，統籌外包稽核管理小組會議召開事宜及相關工作，外包人員製作核發識別證，100%納管。並於104.11.23實施第一次外包業務聯合查檢制度，對外包業務及外包人員管理邁入新的里程碑。
二、門禁管制規範與夜間門戶管制
104.11.1增聘保全人力2名，購置通關機設施，於105.3.1起實施醫院夜間門戶管制；家屬須持有陪伴證，訪客須憑相關身份證件換發訪客證進入院內，並配合院區24小時保安巡邏，設定巡邏點及制定巡邏表單，由保安人員巡邏時主動查檢發現各項異常事件，每月進行數據統計監測改善，整體提升醫院安全防護。
1.105.2.1起進行來賓停車場全面整建，入口新設剩餘車位計數燈箱、自動繳費機設備、車位在席偵測系統等設備，並於105.12.28導入實施自動化車牌辨識系統，持續改善停車場軟硬體設施，提供更安全友善的停車環境。
2.106.2.1與資訊室合作完成「汽機車尚餘車位」、「停車場資訊」、「周邊汽車停車資訊」於網站公告。
3.106.4.28與資訊室合作完成「市公車及客運車行駛動態訊息」於大廳螢幕公告。
未來展望
一、各組工作流程改善，發揮工作效率、節省資源為目標。
二、邁向智能後勤事務管理系統。
三、便利的交通秩序與安全的環境。
四、落實外包作業及外包人力資源管理，創造非醫療業務價值。
五、落實JCI、醫院評鑑之作業標準。
六、配合院方政策，達成醫院發展計畫。