醫療事務室依業務專業設有三組：保險醫療組、櫃檯組、病房書記組

        本室置主任1名，副主任1名(待聘)，依設置辦法得分設櫃檯組、書記組、保險醫療組，三組各置組長1名及行政人員若干人。

主要辦理醫療行政業務包括：

門、急診掛號批價收費作業、中央電腦簽床確認連絡作業、出入院手續及醫療費用收繳作業、醫療費用證明書開立業務、辦理特約機關（構）及事業單位記帳費用申請、保險機關業務連繫管理、全民健康保險各項醫療費用之申報、抽審、申復、爭議審議處理等事宜。本科室宗旨與任務如下：

（一）提供以病人為中心的醫務行政服務。

（二）配合醫院總體發展目標，提升醫務管理專業化。

（三）善盡醫療相關行政業務職責，確保醫院營運收入。