行政管理中心成立於2006年8月轄管行政室、公關室、企劃室、績效室與醫品室，為一具整合性功能之幕僚單位。

　　行政室原為秘書室，成立的歷史最悠久，為歷任院長所倚重之單位，曾擔任秘書職務計有：莊水炎、林良三、陳榮煌、陳建立、楊長興、周建河、邱亨嘉、陳立中、陳建志等，共同領導秘書室團隊成員，襄助院務之推動。

　　企劃室、績效室與醫品室，則由原管理室與原學校醫院發展研究中心之績效組，整併為本中心所轄管之單位。管理室設置於1991年8月，由李昭男副院長擔任主任，1994年林幸道副院長、1999年陳建立分別擔任主任職務。學校於2001成立醫院發展研究中心，其中績效組成員由學校派駐各臨床科，擔任科經營之經理人。醫院發展研究中心於2006年7月裁撤，績效組隨即併入本中心。

　　公共關係室2003年10月成立，由本校醫學社會學與社會工作學系助理教授陳政智兼主任，並借調護理部周詩敏小姐協助處理相關業務 ， 2014年8月由行政管理中心分出為獨立科室，2015年8月再次整併入行政管理中心 。 西元2018年11月公關室改為公共事務室，轉編隸屬副院長。

　　醫療政策、醫療環境與醫療需求快速地的改變，醫院經營管理也要配合共同演化，持續改善、精益求精。組織設計不外分工與協調，醫院組織分工精細，致使體系日益龐大，基於協調與整合的重要性，行政管理中心在此前提下設置，亦象徵著本醫院因應不同發展階段的需要，而設計不同的功能結構 ， 2016年更名為行政暨品質管理中心 。

　　本中心以行政專業幕僚為角色定位，襄助院務發展之策略規劃與日常方針管理之落實，責任重大。本中心人力資源素質優良，同仁們具工作熱忱，積極進取，能完成本職所肩負之責任。本醫院長期以來皆有不同階段的發展計畫與重點，我們在醫院的發展策略下，不斷的進行改善與價值創新活動，發揮專業幕僚的管理功能，期使醫院管理更合理化與效率化，來服務我們的顧客。