本科成立於 1990年，由劉文章醫師擔任創科主任，歷經張文宇醫師、賴春生醫師、何啟功醫師等數位主任，逐步的規畫發展各項服務事業，以致有今日之規模。尤其在何主任任內加強與政府機關及事業單位的合作關係，不僅對職業病防治的推動成果在南台灣有目共睹，而且在職業病的診療與鑑定上，主導協助因硫酸氣暴露導致鼻咽癌的電信員工獲得職業病的認定。

　　本科之工作執掌包括職業病的診斷治療、追蹤及管理，提供工廠事業單位有關職業病防治的諮詢，現場進行訪視採樣以了解危害來源並提供適當的建議，推廣工業安全衛生教育，培訓醫護人員充實職業醫學人力，並從事相關的研究工作。

　　為了讓服務的品質更完好，我們與健康管理中心(原名保健科)為勞工的健康維護及職業病防治共同努力，同時發揮職業醫學科的專業，替勞資雙方謀共同福利，目前提供每日門診服務，並配合各臨床科為職業病患者提供照會服務，以及臨廠訪視服務等。

　　另外因應政府為加強照顧民眾需求所規畫的職業病診療通報網絡，成立職業傷病診療中心承接相關的職業病轉介鑑定追蹤調查等業務，讓民眾更容易取得職業傷病之診療與輔導相關資源。過去搭配國民健康署的「職場健康推動輔導中心」計畫，以及現階段受勞動部委託成立「職業傷病診治中心」提供南部地區職業傷病診療與鑑定，同時也整合衛生保健相關之資源、職場健康促進的推動輔導等工作，並提供企業廠家配合法令所需之駐廠職業醫學專科醫師人力等服務。