脂蛋白研究平台-脂蛋白檢測及純化
一、發展「陰電性脂蛋白」之醫學檢驗技術
(1) 臨床檢驗對象：欲評估心血管疾病、代謝疾病、發炎反應與老化...等臨床就診病人，範圍涵蓋附設醫院腦神經科、心臟內科、肝膽胰內科、腎臟內科、內分泌新陳代謝內科、過敏免疫風濕內科、感染內科...等病人族群。
(2) 該臨床檢測數值，可以評估心血管疾病風險，進而探討各臨床科之併發症風險、致病機轉及流行病學研究。
(3) 因可能涉及臨床醫學研究與論文發表，檢體取得必需通過人體試驗委員會計畫審查與符合醫學倫理規範。
(4) 檢驗項目包括「陰電性極低密度脂蛋白(V5/VLDL%)」、「陰電性低密度脂蛋白(L5/LDL%)」與「陰電性高密度脂蛋白(H5/HDL%)」之相對定量，簡稱V5% 、L5% 、 H5%檢測。
二、提供從人體分離純化之脂蛋白•從人體分離純化之脂蛋白，可以進行細胞生理及動物實驗，進而探討可能的訊息傳遞路徑與致病機轉，未來尋求新的疾病治療方針。
＊因可能涉及臨床醫學研究與論文發表，檢體取得必需通過人體試驗委員會計畫審查與符合醫學倫理規範。
蛋白質/脂質體學生資研究平台
因應未來在生技產業、生物醫學轉譯研究、乃至於個人化醫療之發展，海量資料分析與異質性資料整合解讀之需求將持續增加，而高速計算大資料庫更是目前科學研發的基礎，本中心配備有 Cisco UCS C460 高速運算主機，擁有4個Intel Xeon E7-4860 @2.27GHz 10核心處理器，全系統共計80個計算核心、131GB 1067MHz DDR3記憶體，InfiniBand QDR 10Gb/s高速網路，搭配網路儲存節點共10TB硬碟空間，整體效能可達60兆次浮點運算（TFLOPS），將可應用於以下分析。
(1)基因體資料分析：生物資訊方法分析新世代定序結果，尋找造成特別的表現型(如疾病)的基因體變異。本平台將以國際級的open-source新世代定序結果分析平台為基礎，和國際一流生醫期刊同步的品管及準確性，根據臺灣定序之一般性品質及深度調整分析的參數, 並加入本中心平台獨有之品質管制分析流程、完整品質控管資訊、變異點資訊(short indels)，將可應用於基因序列分析與註解、基因體分析比較、SNP定位與搜尋與Haplotype 分析。
(2)功能性資料分析：在新世代定序實驗中產生非常大的資料。因此，計算分析上必須要確保高品質、高再現性，分析效率，高通量資料品質，核酸定序所產生的基因表現資訊，蛋白質與染色體札合區段定序等，將可應用於轉錄體分析、疾病關聯性分析、基因晶片資料分析並結合本中心高通量脂質及脂蛋白研究平台進行脂質與蛋白體資料庫分析比對。
(3)大數據資料管理建構與分析：電腦科學的快速發展造就了大量(volume)及多樣性(variety)數據資料的快速(velocity)累積，因此建構數據資料的管理分析平台有其必要性。
本平台將規劃彙整本中心各項實驗成果之數據資料於網路儲存系統，並主動收錄或建置相關資料庫系統，
如脂質及脂蛋白臨床治療追蹤資料庫，如：全民健康保險研究資料庫、高醫體系治療追蹤資料庫及政府單位可提
供之健康行為調查之資料庫等。本平台將可應用於健保資料庫及衛生福利相關資料庫研究、臨床治療追蹤資料庫
研究、自動化分析流程建立與實驗室數據資料系統之規劃與建構。
代謝體學研究平台
醣化作用廣泛表現於蛋白質後轉譯作用，目的在於調控蛋白質胞內運輸、蛋白質活性、蛋白質穩定度、蛋白質結構、蛋白質可溶性、與蛋白質多型性。
近年來的醫學研究逐漸聚焦於了解醣化作用與人類疾病的相關性，包括癌症、新陳代謝症候群、糖尿病、血脂失衡、心血管疾病、免疫疾病等。
因此建立醣化作用研究平台可促進醣化作用相關疾病研究深度、多樣性、與效能。在醣化作用研究平台，本研究團隊可鑑別醣化作用類型、醣化作用酵素催化路徑、醣基構成與結構多樣性。
透過醣化作用研究平台與本校附設醫院研究單位合作，可建立各種相關疾病之醣化作用資料庫，提供本校研究學者相關資訊。
醣化作用研究平台建構目標如下：
1.本研究平台將提供酵素去醣基法分析醣蛋白基本醣基構成。
2.本研究平台將提供微流體結晶篩選法分析醣蛋白醣基結構多樣性。
3.本研究平台將提供LC/MSE 儀器分析醣蛋白醣基構成與結構。
4.本研究平台將提供siRNA 默化醣化作用相關酵素基因分析醣蛋白醣基構成路徑。
