▋榮獲第二屆國際醫療典範獎 個人組─高雄醫學大學附設醫院 蔡季君醫師

▋榮獲NHQA國家醫療品質獎─北緯23度下的熱血-亞洲被忽略熱帶疾病防治重鎮 [優選]

▋榮獲SNQ國家品質標章─披荊斬棘，負重前行—面對新興與熱帶傳染病的挑戰(2023-迄今)

▋榮獲SNQ國家品質標章─北緯23度下的熱血-亞洲被忽略熱帶疾病防治重鎮 (2016-2023)

▋榮獲TAF ISO15189 認證(2012-迄今)

▋103.12.11榮獲 醫策會評核P3實驗室「生物安全知能」醫療品質競賽中獲得優良獎

▋101.11.04榮獲 蔡季君醫師榮獲高雄市醫師公會高杏獎