肝炎是我國國民最重要的疾病之一。從慢性肝炎、肝硬化以至於肝癌，這肝病的三部曲一直是我們台灣國民的最痛，對國民健康的威脅相當巨大。是以對於肝炎的研究、教學與服務是本土醫療相關人員無可旁騖的職責與使命。南台灣是本土肝臟疾病盛行率偏高的地域，是以肝病相關的研究、教學與服務在本院地處的南台灣更顯現其必要性與急迫性。

       本中心於2011年7月28日世界肝炎日正式成立，結合本院相關臨床科、社區醫學部、本校相關研究單位、院外醫療健康單位及社會公益團體與志工，能有效整合資源，實施有特色的醫療發展，帶動跨科室的肝病相關研究、教學與服務，相關人才的培養；對外深入基層、服務鄉里，落實預防重於治療與本院之社會責任。中心之目標為︰ 建立以肝炎預防為基礎的基層衛生教育訓練、建立以肝炎為主軸的整合研究中心、建構以病人為中心的肝炎醫療照護 、其他有關肝炎防治促進事項 。

肝炎防治中心目前設有:

一、社區教育服務組: 社區服務是提供公共利益的志願性工作，且目的是在提升生活品質，而擁有真正的生活品質，除了生理上的健康，還有心理上的健全。肝炎及其相關疾病不僅嚴重影響國人的健康，也深深的影響病患及其家屬心理方面的健全。走入社會，深入基層推行各項肝炎防治篩檢服務計畫是肝炎防治中心成立的重要目的。

二、醫療研發組: 持續的研究是本院最卓著的傳統與使命。肝炎防治中心設立頂尖醫療研發組目的在於整合有限資源，進行尖端的肝病研究，以探討最好最適當的臨床診斷與治療模式。

三、跨領域整合研究組: 因應預防醫學與轉譯醫學的新趨勢，肝炎防治中心增設了「跨領域整合研究組」，整合基礎與臨床相關單位，以進行跨領域的合作研究。合作研究範圍將以現有的病毒性肝炎研究為基礎，延伸至遺傳醫學、內分泌新陳代謝與病毒學研究等領域。

四、行政組: 行政作業、相關聯繫等。