本院為統合各臨床部門之人力與資源，提昇移植醫學及基礎研究於2002年8月成立器官移植中心，2003年8月改組為移植中心，並將器官移植列為發展重點。本中心除聯繫院內、外器官捐贈移植，協調院內移植及相關支援部門外，還提供民眾及醫護人員器官捐贈移植相關諮詢服務。
主要工作事項：
- 聯繫並協調院內、外器官捐贈及移植作業的進行.
- 協調移植部門器官移植作業.
- 評估等待器官移植患者與資料登錄.
- 送健保局事前審查移植等候病患資料.
- 送衛生署申請新增移植項目之醫院與醫師資格.
- 追蹤移植術後病患與資料登錄.
- 辦理相關在職教育訓練.
- 器官捐贈宣導.
- 協助相關移植研究與動物實驗.
- 提供相關諮詢.